33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2109 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2109  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 252 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204177  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27540  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  32.61 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 80 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  29.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  37.25 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.25 
 
 		 199 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 86 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 68 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 110 aa  42  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 181 aa  42  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  28.07 
 
 		 181 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  37.25 
 
 		 182 aa  42  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>