More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1825 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5212  nitrate reductase subunit beta  67.99 
 
 		 560 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  0.717062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3674  nitrate reductase, beta subunit  67.91 
 
 		 561 aa  784    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364422  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0901  nitrate reductase, beta subunit  67.74 
 
 		 561 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2039  nitrate reductase, beta subunit  65 
 
 		 511 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3700  nitrate reductase, beta subunit  66.97 
 
 		 554 aa  779    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5442  nitrate reductase (beta subunit)  73.39 
 
 		 553 aa  797    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1236  nitrate reductase, beta subunit  64.95 
 
 		 507 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.222412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3139  nitrate reductase, beta subunit  66.55 
 
 		 576 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.250265  hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1762  nitrate reductase, beta subunit  74.16 
 
 		 566 aa  852    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  68.09 
 
 		 543 aa  795    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1262  respiratory nitrate reductase beta subunit  70.09 
 
 		 551 aa  784    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1206  respiratory nitrate reductase beta subunit  64.39 
 
 		 538 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18710  respiratory nitrate reductase beta subunit  67.59 
 
 		 544 aa  759    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0498038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0315  respiratory nitrate reductase beta subunit  68.72 
 
 		 557 aa  780    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4477  nitrate reductase, beta subunit  66.23 
 
 		 526 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.619422  normal  0.432155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0508  respiratory nitrate reductase beta subunit  61.76 
 
 		 549 aa  668    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.408187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  72.16 
 
 		 584 aa  827    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1279  respiratory nitrate reductase beta subunit  70.09 
 
 		 551 aa  784    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.319698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4545  nitrate reductase, beta subunit  72.84 
 
 		 550 aa  816    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  61.57 
 
 		 519 aa  660    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1288  nitrate reductase, beta subunit  70.09 
 
 		 551 aa  783    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2157  nitrate reductase, beta subunit  73.03 
 
 		 550 aa  840    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2804  nitrate reductase, beta subunit  83.01 
 
 		 558 aa  940    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.477441  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0178  nitrate reductase, beta subunit  60.9 
 
 		 539 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4428  nitrate reductase, beta subunit  70.38 
 
 		 588 aa  802    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1825  nitrate reductase, beta subunit  100 
 
 		 559 aa  1164    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41544  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0193  nitrate reductase, beta subunit  61.03 
 
 		 539 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0137302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11187  respiratory nitrate reductase beta subunit narH  68.56 
 
 		 558 aa  780    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.7 
 
 		 491 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  57.7 
 
 		 491 aa  633  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  57.49 
 
 		 491 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  57.29 
 
 		 491 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  57.29 
 
 		 491 aa  628  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1986  respiratory nitrate reductase, beta subunit  55.56 
 
 		 517 aa  616  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.45 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  57.46 
 
 		 489 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  56.05 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  56.56 
 
 		 508 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  56.35 
 
 		 509 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  56.21 
 
 		 509 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2468  nitrate reductase, beta subunit  55.68 
 
 		 519 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2420  nitrate reductase, beta subunit  55.68 
 
 		 519 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  55.36 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0121  nitrate reductase, beta subunit  56.35 
 
 		 509 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  56.21 
 
 		 509 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1853  nitrate reductase, beta subunit  55.36 
 
 		 517 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  55.36 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1629  nitrate reductase, beta subunit  56.35 
 
 		 509 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2682  nitrate reductase, beta subunit  55.36 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1544  nitrate reductase, beta subunit  56.35 
 
 		 509 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1732  nitrate reductase, beta subunit  55.16 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  55.71 
 
 		 507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2075  respiratory nitrate reductase subunit beta  55.69 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  57.26 
 
 		 511 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  57.26 
 
 		 511 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2242  nitrate reductase, beta subunit  55.16 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0484783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3076  nitrate reductase, beta subunit  55.16 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1515  nitrate reductase, beta subunit  55.16 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1582  nitrate reductase, beta subunit  54.9 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000310576  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  56.14 
 
 		 507 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  55.71 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  55.27 
 
 		 513 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  54.81 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.14 
 
 		 507 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  57.06 
 
 		 511 aa  601  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  55.27 
 
 		 513 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2258  nitrate reductase, beta subunit  56.91 
 
 		 521 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6185  nitrate reductase, beta subunit  55.6 
 
 		 507 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950636  normal  0.0269219 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  56.2 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5003  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.73 
 
 		 515 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2127  nitrate reductase, beta subunit  57.06 
 
 		 509 aa  598  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2227  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.83 
 
 		 512 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.414586  normal  0.0461834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2303  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.83 
 
 		 512 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.932469  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  56.85 
 
 		 505 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  56.2 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  56.01 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  55.69 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  55.98 
 
 		 515 aa  594  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  54.81 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.53 
 
 		 519 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.71 
 
 		 508 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  55.01 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  55.49 
 
 		 504 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0274  nitrate reductase, beta subunit  54.81 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542879  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  56.6 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1648  nitrate reductase, beta subunit  55.26 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2180  nitrate reductase, beta subunit  56.81 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01437  hypothetical protein  56.6 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  56.02 
 
 		 512 aa  590  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  56.08 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2077  nitrate reductase 2, beta subunit  56.81 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  55.88 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  56.65 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1551  nitrate reductase, beta subunit  55.46 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  55.36 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1707  nitrate reductase 2, beta subunit  56.81 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.764488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  56.81 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  53.94 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  55.88 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  54.97 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>