More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1479 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1479  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  100 
 
 
404 aa  795    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2010  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  63.48 
 
 
415 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20970  cysteinyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 
425 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.842697  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2287  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  57.31 
 
 
414 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5399  cysteinyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
427 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139344  normal  0.289642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1195  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  56.07 
 
 
423 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  0.0718449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2247  cysteinyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 
420 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5930  Cysteine--tRNA ligase  56.17 
 
 
407 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1832  cysteinyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 
412 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2668  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  54.48 
 
 
422 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22240  cysteinyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
415 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0725298  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1836  cysteinyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1932  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  55.75 
 
 
403 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1544  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside ligase  53.75 
 
 
407 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.965113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2201  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  55.64 
 
 
412 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0760868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2168  cysteinyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 
426 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0428201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2780  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  56.34 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474656  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2642  cysteinyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 
464 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.736924  normal  0.302095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3049  cysteinyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0153969  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2168  cysteinyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 
404 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258931  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4892  cysteinyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
444 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00699487  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2628  cysteinyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
397 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3153  cysteinyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
415 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0176981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1172  cysteinyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
403 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13890  cysteinyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
438 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0162649  normal  0.816908 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3215  cysteinyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
415 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3165  cysteinyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
415 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2442  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  52.88 
 
 
413 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11810  cysteinyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
422 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.474792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2140  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  52.28 
 
 
414 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3478  cysteinyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
429 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2322  cysteinyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
412 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165765  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16240  cysteinyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
416 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.038458  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12161  cysteinyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
414 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1911  cysteinyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
410 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000250833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4502  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  49.64 
 
 
431 aa  355  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1230  Cysteine--tRNA ligase  43.64 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1206  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
392 aa  269  8e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4315  cysteinyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
401 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3331  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.552746  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2860  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000103148  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1967  cysteinyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
493 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 
501 aa  227  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
493 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
474 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
468 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
511 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
454 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
486 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
499 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
475 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
489 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
498 aa  215  9e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
494 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
459 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
487 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
480 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
472 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 
489 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
480 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6809  cysteinyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
495 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
481 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
516 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
464 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  32 
 
 
476 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
476 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
489 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
500 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
461 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
461 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
478 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
478 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0825  cysteinyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
500 aa  205  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1992  cysteinyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
419 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162619  normal  0.881095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
484 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
466 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
499 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
468 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  35.57 
 
 
497 aa  205  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
484 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
476 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
482 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0549  Cysteine--tRNA ligase  40.16 
 
 
372 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
459 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
461 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
489 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  34.11 
 
 
485 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
457 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
500 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2320  cysteinyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
459 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0745379  hitchhiker  0.000096837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2456  cysteinyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
474 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
453 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
464 aa  203  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
458 aa  203  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
481 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>