23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0845 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  634    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  46.32 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  50.23 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  43.75 
 
 
303 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  38.43 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4973  hypothetical protein  34.5 
 
 
309 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  41.36 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4460  hypothetical protein  35.81 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.120512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  42.26 
 
 
339 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  40.38 
 
 
336 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  37.93 
 
 
285 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  37.65 
 
 
276 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  40.52 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  34.36 
 
 
296 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  30 
 
 
313 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  34.03 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  33.15 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  28.47 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  30 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8212  hypothetical protein  26.56 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4641  hypothetical protein  28.06 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1315  hypothetical protein  30.67 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1139  hypothetical protein  25.74 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>