36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4575 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  946    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  54.65 
 
 
459 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  34.63 
 
 
442 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  29.01 
 
 
413 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  27.32 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  35 
 
 
345 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  29.14 
 
 
426 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  28.46 
 
 
443 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  29.25 
 
 
380 aa  100  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  32.82 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  25.77 
 
 
408 aa  91.3  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  28.87 
 
 
313 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  24.15 
 
 
387 aa  87  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  27 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  27.49 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  28.51 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  30.26 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  28.64 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  26.54 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  25.82 
 
 
380 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  30.59 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  29.73 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  27.15 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  29.05 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  26.64 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3280  hypothetical protein  26.16 
 
 
371 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  28.73 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  26.01 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2365  hypothetical protein  26.7 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0153021  normal  0.414563 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  22.8 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3620  hypothetical protein  24.66 
 
 
400 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  21.39 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1950  hypothetical protein  24.87 
 
 
312 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00445675  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  23.33 
 
 
306 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5952  hypothetical protein  22.31 
 
 
400 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1136  hypothetical protein  24.62 
 
 
334 aa  43.9  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>