16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2098 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  43.28 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  42.03 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  49.18 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  45.31 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  46.88 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  43.66 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  52.63 
 
 
65 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  39.34 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  42.19 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  48.78 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  48.78 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  36.51 
 
 
137 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  37.7 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  40 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>