40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1545 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1545  amine oxidase  100 
 
 		 732 aa  1492    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  43.17 
 
 		 689 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  42.56 
 
 		 688 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  42.34 
 
 		 687 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1533  amine oxidase  43.57 
 
 		 682 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3456  methyltransferase type 11  41.01 
 
 		 698 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0101492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5079  hypothetical protein  42.23 
 
 		 687 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  23.57 
 
 		 527 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  25.16 
 
 		 459 aa  54.3  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  25.28 
 
 		 470 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0671  Methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 220 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  23.99 
 
 		 444 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  24.52 
 
 		 527 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  23.58 
 
 		 628 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5641  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.27 
 
 		 220 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.33 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  29.05 
 
 		 219 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  26.97 
 
 		 473 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  37.66 
 
 		 843 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  23.8 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  24.32 
 
 		 463 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 225 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 262 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.55 
 
 		 612 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  24.46 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  47.17 
 
 		 488 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  39.02 
 
 		 462 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 248 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  30.95 
 
 		 519 aa  45.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 200 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 200 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 248 aa  45.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  30.77 
 
 		 217 aa  44.7  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 217 aa  44.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  44.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.65 
 
 		 258 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 323 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 323 aa  44.3  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 333 aa  43.9  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 221 aa  43.9  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>