45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1410 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  377  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  47.64 
 
 
193 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  48.17 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  47.64 
 
 
192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  51.15 
 
 
192 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  47.94 
 
 
192 aa  180  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  50.89 
 
 
192 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  46.29 
 
 
192 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  45 
 
 
192 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  39.04 
 
 
243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  44.23 
 
 
227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  44.23 
 
 
243 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  44.1 
 
 
227 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  43.95 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  43.12 
 
 
250 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  38.24 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  37.06 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  37.06 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  35.11 
 
 
195 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  34.97 
 
 
195 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  36.22 
 
 
200 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  36.88 
 
 
194 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  34.57 
 
 
215 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  33.71 
 
 
194 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  34.3 
 
 
189 aa  97.8  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  31.91 
 
 
195 aa  84.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  34.18 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  29.3 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  32.08 
 
 
459 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  26.72 
 
 
445 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  31.13 
 
 
490 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  25.81 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  31.78 
 
 
476 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  34.68 
 
 
442 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  29.75 
 
 
488 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  30.97 
 
 
476 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  35.48 
 
 
438 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  27.01 
 
 
464 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  32.93 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  41.1 
 
 
465 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  26.83 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  28.7 
 
 
480 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  28.7 
 
 
480 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  24.84 
 
 
222 aa  41.6  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  33.98 
 
 
472 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>