More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0113 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0113  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 
104 aa  215  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5902  putative iron-sulfur cluster assembly protein  71.84 
 
 
109 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316321  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  61.76 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3644  HesB/YadR/YfhF-family protein  56.57 
 
 
118 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0398  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
118 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770041  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.52 
 
 
134 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  49.49 
 
 
118 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1065  HesB/YadR/YfhF  46.46 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5109  HesB/YadR/YfhF-family protein  47.47 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  52.75 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  52.75 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  46.46 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.39 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4470  HesB/YadR/YfhF  44.44 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.24 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.24 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  37.89 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.34 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  40.22 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.22 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  35.11 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.21 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  32.29 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.21 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.21 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  37.89 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  39.02 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  39.02 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.67 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  31.73 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  33.33 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.34 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  36.46 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.23 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  31.25 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  31.63 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  35.87 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.96 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.18 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
106 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.04 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.05 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  33.68 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  34.04 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  32.63 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.02 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  34 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.47 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.32 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.26 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1694  FeS assembly scaffold SufA  31.91 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.894129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.42 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.63 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.42 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.91 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  32.29 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  33.67 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0466  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.68 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0234938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  27.08 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.78 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.02 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.65 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.76 
 
 
108 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.99 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  31.73 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  27.08 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.65 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.63 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  32.26 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.25 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.25 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.25 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.47 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.25 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.25 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.25 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.58 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.58 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.29 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.56 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  30.53 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.29 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.29 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.65 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.29 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.29 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.61 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.29 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.29 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.29 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.29 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>