More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3875 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3875  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
399 aa  794    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0793406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  33.59 
 
 
387 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 
391 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
390 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
395 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
405 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
390 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  33.6 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.57 
 
 
393 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
393 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.17 
 
 
384 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
402 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 
387 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
400 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 
387 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0904  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
386 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
387 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
387 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.03 
 
 
400 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  31.93 
 
 
388 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
387 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
387 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
391 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.03 
 
 
400 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
387 aa  169  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  33.33 
 
 
370 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
387 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
392 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
381 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
387 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
382 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
387 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.95 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.95 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
387 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
395 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.24 
 
 
386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.24 
 
 
386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 
390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 
387 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  31.4 
 
 
415 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  31.4 
 
 
415 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
385 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.03 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  31.4 
 
 
490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.93 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
387 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.13 
 
 
637 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
387 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 
387 aa  162  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
381 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  31.48 
 
 
382 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 
399 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
400 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  33.13 
 
 
394 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
382 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.77 
 
 
400 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
384 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
386 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
382 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
384 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 
379 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0499  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
401 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145153  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
382 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 
398 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  29.06 
 
 
385 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003574  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
397 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
381 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
386 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
387 aa  159  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
386 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
387 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  29.06 
 
 
385 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  30.53 
 
 
383 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
382 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
385 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0510  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
401 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.700521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.04 
 
 
382 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  29.89 
 
 
382 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
401 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  29.89 
 
 
382 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.46 
 
 
388 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>