38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1597 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  49.4 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  38.2 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  36.02 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.55 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  38.33 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  37.39 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.39 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  37.39 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.29 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.29 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  35.37 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.37 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.51 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.4 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  36.55 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  34.03 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  34.5 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.62 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  36.2 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  35.81 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  33.92 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  33.63 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  34.03 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.3 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  30.23 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  30.7 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.52 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.29 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  30.26 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  32.95 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  32.57 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  25.71 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  26.94 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  22.84 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2983  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.46 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.95 
 
 		 755 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>