79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1039 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1039  uroporphyrinogen III synthase  100 
 
 		 282 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2378  uroporphyrinogen-III synthase  61.59 
 
 		 272 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2891  uroporphyrinogen-III synthase  60.87 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.328432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1998  uroporphyrinogen III synthase  59.49 
 
 		 279 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2231  uroporphyrinogen III synthase HEM4  55.96 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41378  hitchhiker  0.0093403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1716  uroporphyrinogen III synthase  50.18 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1375  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  49.64 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3089  uroporphyrinogen III synthase  47.47 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3001  uroporphyrinogen-III synthase  45.39 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00619435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0765  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.89 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000129403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.16 
 
 		 672 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.49 
 
 		 672 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.87 
 
 		 689 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 686 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.47 
 
 		 693 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.97 
 
 		 655 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2467  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.9 
 
 		 655 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.52 
 
 		 702 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0873  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.38 
 
 		 659 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1078  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.93 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.47 
 
 		 695 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1072  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.93 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2283  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.93 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3001  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.93 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1596  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.93 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0731  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.93 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1231  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.93 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0281  uroporphyrinogen-III synthase  31 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.18 
 
 		 656 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0870  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.01 
 
 		 656 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.787739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.47 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  31.54 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.53 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.843372  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  30.99 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.88 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  30.91 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1812  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.38 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2424  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.38 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2428  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.03 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.475486  normal  0.299485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  30.08 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0129  uroporphyrinogen-III synthetase  28.1 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  27.72 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0657  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.93 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  28.78 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.91 
 
 		 579 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0317  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.09 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0061  uroporphyrinogen-III synthase  26.79 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.41 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3666  Na+/H+ antiporter NhaA  25.17 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.232778  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.4 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  28 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  28 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  28.95 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  31.8 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.91 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0439  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.1 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  24.16 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  31.33 
 
 		 516 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0372  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.06 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.01 
 
 		 510 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0257  uroporphyrinogen-III synthase  29.24 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.57 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  27.15 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.64 
 
 		 511 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47590  uroporphyrinogen-III synthase  27.8 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  25.68 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.17 
 
 		 503 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  23.92 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.57 
 
 		 672 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4134  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.51 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.31 
 
 		 513 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.56 
 
 		 508 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3588  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.66 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  22.87 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.27 
 
 		 546 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.99 
 
 		 522 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  25.15 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  24.24 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>