249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3639 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  100 
 
 
223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  72.6 
 
 
220 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  70.32 
 
 
220 aa  323  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  69.16 
 
 
248 aa  298  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  63.01 
 
 
233 aa  288  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  63.08 
 
 
223 aa  264  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  57.94 
 
 
220 aa  261  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  58.88 
 
 
221 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  57.48 
 
 
222 aa  248  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  52.89 
 
 
227 aa  226  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  54.17 
 
 
226 aa  224  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  56.4 
 
 
223 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  57.35 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  53.55 
 
 
222 aa  215  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  52.29 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  49.54 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  49.05 
 
 
222 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  52.13 
 
 
228 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  52.13 
 
 
228 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  52.13 
 
 
228 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  52.13 
 
 
228 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  52.13 
 
 
228 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  51.18 
 
 
319 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  51.66 
 
 
228 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  46.19 
 
 
222 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  46.95 
 
 
231 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  46.19 
 
 
236 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  48.65 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  47.89 
 
 
224 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  46.36 
 
 
221 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  46.36 
 
 
221 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  49.52 
 
 
219 aa  191  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  46.36 
 
 
221 aa  191  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  46.92 
 
 
228 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  47.44 
 
 
223 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  47.17 
 
 
224 aa  190  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  46.01 
 
 
222 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  45.87 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  46.98 
 
 
223 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  46.33 
 
 
224 aa  187  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  46.98 
 
 
223 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  45.71 
 
 
223 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  45 
 
 
221 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  46.98 
 
 
223 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  45.12 
 
 
223 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  46.3 
 
 
231 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  46.05 
 
 
222 aa  184  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  45.89 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  47.39 
 
 
226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  42.52 
 
 
223 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  45.71 
 
 
234 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  44.86 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  43.72 
 
 
225 aa  176  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  43.58 
 
 
226 aa  174  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  44.83 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  47.52 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  45.09 
 
 
225 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  44.61 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  44.29 
 
 
229 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0035  carboxylesterase  45 
 
 
221 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  41.67 
 
 
221 aa  168  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  43.78 
 
 
219 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0410  hypothetical protein  43.78 
 
 
219 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  41.83 
 
 
222 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  40.54 
 
 
218 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  40.09 
 
 
218 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  43.26 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08748  Acyl-protein thioesterase 1 (EC 3.1.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASI2]  38.53 
 
 
239 aa  151  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  39.64 
 
 
218 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  41.59 
 
 
215 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  40.54 
 
 
218 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  40.89 
 
 
229 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  44.19 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  37.22 
 
 
238 aa  142  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  40.28 
 
 
219 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  40.55 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  41.21 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  39.72 
 
 
218 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  39.07 
 
 
219 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  41.62 
 
 
193 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  33.77 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  39.02 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32853  predicted protein  35.91 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  34.13 
 
 
204 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  34.13 
 
 
204 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  32.24 
 
 
205 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  38.42 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  35.65 
 
 
220 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  36.41 
 
 
224 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2587  phospholipase/carboxylesterase  50 
 
 
124 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000792011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  31.53 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  32.24 
 
 
221 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33720  predicted protein  32.35 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  35.68 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  29.58 
 
 
230 aa  95.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2584  phospholipase/carboxylesterase family protein  45 
 
 
101 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  34.47 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  32.43 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  30.48 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  34.11 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>