53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3634 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 143 aa  296  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  44.85 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1969  hypothetical protein  41.86 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  33.59 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  33.08 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1891  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4363  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  32.2 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1469  hypothetical protein  35.04 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0113  ketosteroid isomerase-like protein  31.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1210  ketosteroid isomerase-like protein  26.92 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187179  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02403  hypothetical protein  29.82 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  28.57 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5451  hypothetical protein  32.95 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  28.24 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  28.24 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  28.24 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  28.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  27.94 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0816  hypothetical protein  26.96 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403469  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  27.5 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  26.67 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  27.5 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  32.29 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  24.24 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2225  hypothetical protein  26.55 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  27.56 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  23.02 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1067  hypothetical protein  26.05 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3483  protein of unknown function DUF1486  24.14 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  24.14 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  23.48 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0787  hypothetical protein  26.67 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0827  hypothetical protein  26.67 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000717124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  25 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  26.67 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  21.26 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  28.85 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2394  hypothetical protein  24.79 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.358129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  24.14 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  36.96 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  23.62 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  27.13 
 
 		 130 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  27.13 
 
 		 130 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  27.13 
 
 		 130 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.62 
 
 		 130 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  24.59 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  26.26 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  23.13 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>