37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2502 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 		 101 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  84.16 
 
 		 101 aa  187  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  82.18 
 
 		 105 aa  186  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  81 
 
 		 101 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  80 
 
 		 101 aa  180  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  79 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  79 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  79 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  78 
 
 		 101 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  67.33 
 
 		 101 aa  160  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  71.72 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  66 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  67.68 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  54 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  55 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  52.48 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  45.26 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  45 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  41.84 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  55.56 
 
 		 73 aa  94.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  41.84 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  41.84 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  41.84 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  41.49 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  41.49 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  41.49 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  42.86 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  42.86 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  38.78 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  41.49 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  37.5 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  35.35 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  36.36 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  35.05 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1204  hypothetical protein  38.46 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>