105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0143 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  65.03 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  64.66 
 
 		 283 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  66.08 
 
 		 299 aa  362  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  63.83 
 
 		 281 aa  360  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  63.35 
 
 		 281 aa  360  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  62.94 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  61.51 
 
 		 278 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  54.06 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  47.33 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  38.49 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  38.1 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  38.1 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  36.16 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  36.9 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  36.33 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  36.68 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  36.36 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  34.63 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  35.99 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  35.99 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  36.9 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  36.33 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  36.33 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  36.33 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  35.04 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  35.17 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  34.4 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  36.46 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  35.21 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  34.06 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  34.06 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  33.22 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.06 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  34.98 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  36.1 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  33.94 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  34.96 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  31.64 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  34.29 
 
 		 424 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  34.55 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  34.29 
 
 		 424 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  32.85 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  30.95 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  31.48 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  32.3 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  29.45 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  29.93 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  30.22 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  29.87 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  30.58 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  29.85 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  30.07 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  35.02 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  28.98 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  32.65 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  31.43 
 
 		 174 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  32.28 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  33.78 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  32.43 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.05 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.05 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.05 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.05 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.05 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.05 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.05 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.81 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  30.29 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.26 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  31.37 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  29.64 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  30.47 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  28.47 
 
 		 605 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  27.87 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  25.18 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  29.63 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  36.89 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  36.89 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  25.25 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  31.76 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  31.16 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  28.81 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  25.83 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  28.52 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  26.47 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.08 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  27.08 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  26.62 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.21 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  25.9 
 
 		 338 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  27.96 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  29.45 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2768  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5285  metallophosphoesterase  26.76 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3964  metallophosphoesterase  30.71 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  normal  0.285649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  26.53 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>