28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_10 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_10  conjugative transfer protein TraW  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4440  Type-F conjugative transfer system protein TraW  52.43 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4436  type-F conjugative transfer system protein TraW  52.43 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4504  type-F conjugative transfer system protein TraW  51.71 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4380  type-F conjugative transfer system protein TraW  52.43 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4625  type-F conjugative transfer system protein TraW  52.43 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.992318 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4533  type-F conjugative transfer system protein TraW  52.43 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.8295 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4292  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  38.32 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0030  hypothetical protein  35.07 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4002  hypothetical protein  35.2 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.760813  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5375  Type-F conjugative transfer system protein TraW  33.17 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2166  hypothetical protein  32.52 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2657  hypothetical protein  32.41 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1531  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.99 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337431  normal  0.871932 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0027  conjugal transfer pilus assembly protein TraW  34.67 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0348  sex pilus assembly protein  32.86 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0022  hypothetical protein  30.29 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6168  type-F conjugative transfer system protein TraW  33.82 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00281351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2324  hypothetical protein  30.96 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6804  hypothetical protein  31.25 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4230  hypothetical protein  28.78 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4175  hypothetical protein  29.55 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0943876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0250  hypothetical protein  28.64 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0313  conserved hypothetical cytosolic protein  29.25 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6263  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3774  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0973  putative cytoplasmic protein  22.54 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.545358  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6233  sex pilus assembly and synthesis protein  21.88 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4208  hypothetical protein  21.76 
 
 		 431 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000759939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>