42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0558 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  179  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  87.06 
 
 		 91 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  83.53 
 
 		 89 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  61.18 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  53.16 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  43.53 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  40.24 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  41.46 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  37.8 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  38.03 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  37.33 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  35.37 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  34.12 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  29.41 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  32.94 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  31.17 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3444  hypothetical protein  38.81 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.935963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  35.14 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  35.14 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  37.97 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  34.94 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  30.59 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  36.78 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  37.88 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  46.15 
 
 		 53 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  33.78 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  44 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  29.17 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  28.24 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  33.78 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  31.65 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  29.89 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  47.5 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  35.85 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  29.69 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  29.69 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>