More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0205 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  100 
 
 
246 aa  514  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  35.94 
 
 
222 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  28.95 
 
 
209 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.18 
 
 
235 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  25.71 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 
211 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.94 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.4 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  24.4 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.51 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.84 
 
 
206 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.41 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  25.62 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.41 
 
 
219 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.41 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.94 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  27.01 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.94 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  27.01 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.94 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
205 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  23.04 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  23.04 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  23.04 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  23.04 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  23.04 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  23.04 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  23.04 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  25.12 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  23.9 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  22.55 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.64 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.79 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.32 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  24.32 
 
 
221 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.88 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.94 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  24.76 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.54 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.39 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.54 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  24.15 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  21.18 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  23.08 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.38 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  21.74 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.81 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.81 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  22.77 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.37 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  27.18 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.97 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  28.9 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.17 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  23.16 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.54 
 
 
192 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.86 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.37 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.04 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.63 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  23.35 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.35 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.35 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.79 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.84 
 
 
220 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.11 
 
 
220 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.35 
 
 
220 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.35 
 
 
220 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  26.15 
 
 
209 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.74 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.86 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  25 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.1 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.38 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>