More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001770 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  100 
 
 
292 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  40.31 
 
 
311 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.68 
 
 
317 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  34.17 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  41.08 
 
 
326 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40.44 
 
 
326 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40.44 
 
 
326 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  41.3 
 
 
326 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 
326 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.83 
 
 
314 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  35.12 
 
 
317 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
777 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  29.86 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
316 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
324 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
271 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  42.45 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
329 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
333 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  45 
 
 
374 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  49.45 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 
397 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  48.35 
 
 
344 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  48.35 
 
 
344 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
314 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
244 aa  89.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  46.73 
 
 
334 aa  89  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 
322 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  48.35 
 
 
344 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  33.16 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  48.35 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  48.35 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  48.35 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  43.81 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  41.58 
 
 
351 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  48.35 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
311 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.3 
 
 
350 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  38.28 
 
 
344 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 
1035 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 
233 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
275 aa  86.7  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  42.86 
 
 
322 aa  86.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  37.5 
 
 
344 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.79 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
250 aa  85.5  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  37.14 
 
 
326 aa  85.5  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 
672 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  37.5 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  36.72 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  36.72 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.86 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  35.42 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  41 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  42.24 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.98 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.98 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  44 
 
 
390 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  32.98 
 
 
327 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  32.98 
 
 
327 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  48.91 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  39.05 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  41.44 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  36.7 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  34.88 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
689 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>