138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000588 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  80.43 
 
 
305 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  42.53 
 
 
287 aa  231  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  39.33 
 
 
290 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  38.58 
 
 
290 aa  215  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  40.38 
 
 
290 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  39.49 
 
 
357 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  38.85 
 
 
364 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  38.85 
 
 
364 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  38.85 
 
 
357 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  38.85 
 
 
364 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  37.5 
 
 
357 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  37.5 
 
 
357 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  37.5 
 
 
357 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  37.5 
 
 
357 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  37.14 
 
 
357 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  37.14 
 
 
357 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  37.14 
 
 
357 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  37.14 
 
 
357 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  37.14 
 
 
357 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  35.56 
 
 
422 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  35.21 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  35.21 
 
 
424 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  41.54 
 
 
345 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  36.23 
 
 
356 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  36.43 
 
 
343 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  35.25 
 
 
373 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  34.59 
 
 
344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  34.39 
 
 
378 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  32.89 
 
 
415 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  34.14 
 
 
335 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  31.41 
 
 
372 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  31.82 
 
 
372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  33.79 
 
 
335 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  31.01 
 
 
380 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  30.91 
 
 
383 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  31.09 
 
 
372 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  32.58 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  32.82 
 
 
282 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  28.26 
 
 
638 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  30.34 
 
 
279 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  30.34 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  29.52 
 
 
284 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  31.25 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  29.52 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  29.52 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  29.52 
 
 
284 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  29.52 
 
 
284 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  29.52 
 
 
284 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  29.52 
 
 
284 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  29.52 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  29.15 
 
 
284 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  28.78 
 
 
284 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  29.63 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  28.99 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  35.9 
 
 
381 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  29.67 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  29.67 
 
 
290 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  29.67 
 
 
290 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  28.99 
 
 
293 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  29.75 
 
 
304 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  27.68 
 
 
283 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  29.35 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  27.34 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  29.63 
 
 
282 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  26.99 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  28.62 
 
 
293 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  27.55 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  30.4 
 
 
289 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  27.55 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  35.94 
 
 
383 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  26.64 
 
 
283 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  28.9 
 
 
270 aa  122  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  26.99 
 
 
283 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  28.78 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  30.18 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  34.76 
 
 
389 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  28 
 
 
281 aa  118  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  26.3 
 
 
283 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  28.57 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  29.56 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  26.91 
 
 
296 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  29.35 
 
 
290 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.71 
 
 
313 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.39 
 
 
303 aa  99  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.7 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  26.22 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  24.18 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  25.62 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.76 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  26.16 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  28.37 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  25.96 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  28.18 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4675  Patatin  28.48 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.0114015 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10458  hypothetical protein  23.51 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  26.74 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  25.49 
 
 
406 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.67 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  28.65 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>