More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0315 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  70.32 
 
 		 605 aa  897    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 662 aa  1380    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  69.88 
 
 		 605 aa  893    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  45.19 
 
 		 616 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  61.99 
 
 		 390 aa  357  5.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  48.66 
 
 		 266 aa  261  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  46.64 
 
 		 369 aa  251  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.64 
 
 		 370 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.64 
 
 		 370 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  46.64 
 
 		 367 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  45.9 
 
 		 367 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  47.01 
 
 		 367 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  47.01 
 
 		 367 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  45.72 
 
 		 369 aa  243  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  45.35 
 
 		 369 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  45.35 
 
 		 369 aa  241  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  45.35 
 
 		 369 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  45.35 
 
 		 369 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  45.35 
 
 		 369 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  45.35 
 
 		 369 aa  239  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  45.35 
 
 		 369 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  44.98 
 
 		 369 aa  238  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  44 
 
 		 280 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  44.61 
 
 		 369 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  44.61 
 
 		 369 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  44.61 
 
 		 369 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  44.24 
 
 		 369 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  44.61 
 
 		 369 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  44.4 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  44.4 
 
 		 366 aa  228  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  42.75 
 
 		 371 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.36 
 
 		 361 aa  217  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  35.73 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  35.73 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.73 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.02 
 
 		 375 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  44.36 
 
 		 267 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.45 
 
 		 382 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.16 
 
 		 382 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.45 
 
 		 382 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.84 
 
 		 380 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  34.36 
 
 		 373 aa  213  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.97 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  34.97 
 
 		 381 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.45 
 
 		 382 aa  212  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.24 
 
 		 386 aa  211  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.11 
 
 		 385 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  35.45 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.39 
 
 		 381 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.39 
 
 		 380 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.39 
 
 		 380 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.39 
 
 		 380 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.77 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.09 
 
 		 367 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  35.47 
 
 		 379 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  36.71 
 
 		 379 aa  207  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.36 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  36.28 
 
 		 356 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.77 
 
 		 375 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.06 
 
 		 374 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.16 
 
 		 376 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  36.23 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.5 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.5 
 
 		 356 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  35.31 
 
 		 381 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.99 
 
 		 375 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.16 
 
 		 380 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.16 
 
 		 380 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  35.17 
 
 		 366 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  35.17 
 
 		 366 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  33.51 
 
 		 418 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.06 
 
 		 414 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  40.49 
 
 		 287 aa  197  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.1 
 
 		 371 aa  197  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.89 
 
 		 388 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  33.53 
 
 		 368 aa  194  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.65 
 
 		 403 aa  194  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.14 
 
 		 383 aa  194  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  42.54 
 
 		 268 aa  193  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.24 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.43 
 
 		 367 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  35.28 
 
 		 372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.7 
 
 		 407 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.01 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  34.69 
 
 		 372 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  34.24 
 
 		 358 aa  188  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  34.31 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.6 
 
 		 366 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  34.9 
 
 		 364 aa  187  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  32.86 
 
 		 366 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  39.92 
 
 		 263 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.04 
 
 		 365 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  36.5 
 
 		 362 aa  184  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  35 
 
 		 325 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  32.84 
 
 		 355 aa  181  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  42.01 
 
 		 267 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  33.03 
 
 		 364 aa  178  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.71 
 
 		 366 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.43 
 
 		 390 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  34.06 
 
 		 606 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>