More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0407 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0407  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
323 aa  653    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
309 aa  297  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
307 aa  295  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
301 aa  289  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
309 aa  288  9e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
313 aa  287  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 
320 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1807  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34391  hitchhiker  0.00296151 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
312 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 
355 aa  281  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  51.61 
 
 
312 aa  281  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
315 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 
305 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0930  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000010052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
303 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  47.74 
 
 
317 aa  272  6e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
308 aa  272  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
314 aa  272  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
316 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
316 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  48.88 
 
 
313 aa  271  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 
305 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
303 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
304 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06660  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 
331 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
323 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
312 aa  269  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
303 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 
309 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
311 aa  269  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
316 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
316 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
316 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
316 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 
303 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
312 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
312 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  44.7 
 
 
303 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
302 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
312 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 
316 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 
303 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 
308 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
312 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1594  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
308 aa  263  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
316 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
312 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
305 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  47.6 
 
 
313 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 
313 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
309 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
304 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
309 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 
304 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2058  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
307 aa  262  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.638653  normal  0.14695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  42.43 
 
 
306 aa  262  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
316 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
318 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0484  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
313 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
323 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
317 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
318 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
309 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  46.8 
 
 
318 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
309 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  42.81 
 
 
316 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
328 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  43.51 
 
 
305 aa  256  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 
297 aa  256  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 
304 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  44.98 
 
 
304 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0349  ornithine carbamoyltransferase  44.27 
 
 
332 aa  255  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2658  ornithine carbamoyltransferase  42.77 
 
 
336 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2714  ornithine carbamoyltransferase  42.77 
 
 
336 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0825  ornithine carbamoyltransferase  50.82 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  44.7 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 
301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0397  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0463662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 
300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
306 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
302 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
302 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1908  ornithine carbamoyltransferase  44.38 
 
 
331 aa  252  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000351047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
309 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2249  ornithine carbamoyltransferase  43.4 
 
 
335 aa  252  7e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0473  ornithine carbamoyltransferase  42.99 
 
 
332 aa  252  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  44.01 
 
 
309 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2165  ornithine carbamoyltransferase  41.34 
 
 
337 aa  252  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 
306 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>