46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3079 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3079  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3733  hypothetical protein  42.08 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1043  hypothetical protein  43.84 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2420  hypothetical protein  47.42 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4918  hypothetical protein  35.79 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569539  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1502  hypothetical protein  36.51 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15660  hypothetical protein  39.71 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3673  lipoprotein  32.88 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6755  hypothetical protein  35.75 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6720  hypothetical protein  33.49 
 
 		 409 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0306269  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7463  lipoprotein  33.19 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0778  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.557806  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1764  hypothetical protein  34.78 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  35.8 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2829  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1898  putative lipoprotein  32.2 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0926  hypothetical protein  28.72 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2263  hypothetical protein  29.44 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438101  normal  0.0365994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2837  hypothetical protein  25 
 
 		 439 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042289  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1299  hypothetical protein  35.71 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3419  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2241  hypothetical protein  28.35 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000480032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2111  hypothetical protein  25.19 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0913  hypothetical protein  26.84 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.975076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1137  hypothetical protein  22.12 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5253  hypothetical protein  25.36 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.973786  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1142  hypothetical protein  22.18 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3106  hypothetical protein  29.47 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610397  normal  0.841611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0451  hypothetical protein  27.44 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502612  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1930  hypothetical protein  27.81 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  23.39 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2127  hypothetical protein  22.73 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00142301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2133  hypothetical protein  25.52 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.380501  normal  0.0273786 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0904  hypothetical protein  20.83 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2295  hypothetical protein  29.03 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605553  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1536  hypothetical protein  27.81 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.406119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2155  hypothetical protein  22.44 
 
 		 291 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0541  hypothetical protein  24.68 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03115  hypothetical protein  22.17 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.375707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1388  hypothetical protein  26.34 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0971  hypothetical protein  23.7 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5352  hypothetical protein  27.78 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00760583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3686  hypothetical protein  25.15 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2126  hypothetical protein  32.26 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2679  hypothetical protein  20.3 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.869524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1437  hypothetical protein  25.13 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  normal  0.479452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>