19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1539 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1539  Protein of unknown function DUF2174-like protein  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  28 
 
 		 206 aa  72  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  33.12 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  32.04 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  32 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  28.64 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  29.44 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  28.49 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  28.81 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  30.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  28.65 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  27.72 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  30.73 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  29.28 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  30.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  26.57 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  34.78 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  33.85 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>