71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1139 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1139  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
158 aa  320  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0160396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0300  lactoylglutathione lyase  88.39 
 
 
158 aa  291  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00424343  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2378  lactoylglutathione lyase  82.8 
 
 
162 aa  279  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2168  lactoylglutathione lyase  85.62 
 
 
156 aa  278  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71915  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2133  lactoylglutathione lyase  83.23 
 
 
163 aa  276  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2801  lactoylglutathione lyase  78.98 
 
 
169 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1018  methylmalonyl-CoA epimerase  79.87 
 
 
154 aa  266  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2044  lactoylglutathione lyase  82 
 
 
153 aa  262  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0204479  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1854  lactoylglutathione lyase  81.33 
 
 
153 aa  260  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0928  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  79.22 
 
 
155 aa  259  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0914  lactoylglutathione lyase  80 
 
 
155 aa  258  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78 
 
 
153 aa  250  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2516  lactoylglutathione lyase  77.63 
 
 
155 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3777  lactoylglutathione lyase  76.16 
 
 
156 aa  248  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.34023  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3408  lactoylglutathione lyase  73.68 
 
 
155 aa  241  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 
158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46728  predicted protein  61.59 
 
 
186 aa  201  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.64 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 
134 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  28.67 
 
 
141 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  28.08 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  28.08 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  27.54 
 
 
140 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  27.59 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  40.91 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  27.4 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  30.07 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.51 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  27.97 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  40.62 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  28.28 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  27.97 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  27.86 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  29.58 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
161 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  27.34 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.54 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.13 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  28.87 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  26.09 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  30.71 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  27.59 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.62 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  26.21 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  28.46 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
134 aa  43.9  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  28.97 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  34.92 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  25.36 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.88 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  27.97 
 
 
147 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  30.71 
 
 
133 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  24.79 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  36.51 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.16 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  36.51 
 
 
129 aa  41.6  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  29.41 
 
 
129 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
135 aa  41.2  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  39.06 
 
 
192 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  34.92 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  38.46 
 
 
145 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 
134 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  23.78 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  23.08 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>