34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0944 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0944  protein of unknown function DUF1527  100 
 
 
314 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2182  hypothetical protein  97.66 
 
 
314 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2398  hypothetical protein  95.86 
 
 
314 aa  609  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0687  protein of unknown function DUF1527  86.22 
 
 
316 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.340734  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2357  hypothetical protein  84.69 
 
 
316 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000499719  unclonable  0.000000165257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1252  hypothetical protein  83.71 
 
 
315 aa  548  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.613488  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1180  hypothetical protein  81.11 
 
 
315 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4183  hypothetical protein  81.7 
 
 
315 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3428  hypothetical protein  81.76 
 
 
315 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.881387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1394  hypothetical protein  81.05 
 
 
315 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.924671  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1621  protein of unknown function DUF1527  78.76 
 
 
311 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2863  protein of unknown function DUF1527  78.46 
 
 
312 aa  524  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0431  protein of unknown function DUF1527  77.45 
 
 
308 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0490  hypothetical protein  77.45 
 
 
309 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0849  hypothetical protein  70.53 
 
 
312 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1429  hypothetical protein  70 
 
 
312 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36350  hypothetical protein  67.2 
 
 
310 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59990  hypothetical protein  67.26 
 
 
312 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.858519  hitchhiker  0.00000000908984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4520  hypothetical protein  67.26 
 
 
312 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3026  hypothetical protein  57.05 
 
 
318 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2953  hypothetical protein  52.61 
 
 
343 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3331  hypothetical protein  52.61 
 
 
325 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0679  protein of unknown function DUF1527  49.09 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4164  hypothetical protein  49.85 
 
 
335 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0349  hypothetical protein  51.22 
 
 
335 aa  308  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3701  hypothetical protein  48.8 
 
 
317 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.749557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4074  hypothetical protein  49.69 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1775  hypothetical protein  45.75 
 
 
308 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0651  hypothetical protein  43.86 
 
 
340 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3924  hypothetical protein  33.22 
 
 
384 aa  178  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2753  hypothetical protein  33.14 
 
 
431 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408249  normal  0.787486 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1021  hypothetical protein  26.97 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1059  hypothetical protein  26.97 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2393  hypothetical protein  25.98 
 
 
353 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>