More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1034 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1034  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  173  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0754861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  84.71 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0803  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  80.82 
 
 		 83 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  80.82 
 
 		 83 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  68.06 
 
 		 84 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  70.27 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  62.34 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  71.23 
 
 		 87 aa  98.2  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  61.84 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  65.79 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  66.18 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  62.16 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  72.13 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  67.57 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  62.16 
 
 		 83 aa  94  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  63.16 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  65.75 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  63.01 
 
 		 85 aa  93.6  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  63.16 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  62.16 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0809  50S ribosomal protein L27  63.89 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.115464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  60.81 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  60 
 
 		 84 aa  92  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  63.16 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  60.27 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1749  50S ribosomal protein L27  59.46 
 
 		 83 aa  91.7  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000203988  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35728  predicted protein  58.67 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  64.86 
 
 		 85 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  63.01 
 
 		 88 aa  90.5  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  55.06 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  62.16 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32559  Plastid ribosomal protein L27 large ribosomal subunit  60 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0311602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  63.51 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  58.9 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  58.9 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  61.64 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  61.64 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>