More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0482 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  75.54 
 
 		 234 aa  366  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  62.17 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  55.46 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  55.02 
 
 		 231 aa  269  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  47.41 
 
 		 274 aa  203  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  44.21 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  45.69 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  42.67 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  42.86 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  44.68 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  42.42 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  44.54 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  44.16 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  44.59 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  43.04 
 
 		 246 aa  194  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  42.17 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  43.72 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  44.16 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  43.78 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  43.78 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  42.24 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  43.88 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  42.24 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  42.24 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  43.72 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  42.86 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  43.29 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  43.29 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  42.08 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  43.29 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  43.29 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  43.29 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  43.4 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  42.42 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  41.63 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  42.98 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  42.08 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  45.11 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  41.13 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  42.42 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  43.78 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  43.48 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  40.26 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  43.35 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  42.92 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  41.56 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  41.99 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  39.39 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  41.63 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  42.31 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  41.13 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  41.56 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  39.39 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  39.83 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  39.83 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  42.42 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  38.96 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  42.49 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  41.99 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  41.99 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  41.99 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  42.92 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  41.99 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  44.64 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  42.67 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  43.83 
 
 		 242 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  41.56 
 
 		 253 aa  184  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  43.29 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  40.43 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  41.99 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  41.13 
 
 		 242 aa  184  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  41.99 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  42.42 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  41.13 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  42.67 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  42.86 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  41.99 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  41.56 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  41.38 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  42.06 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  39.39 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  39.39 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  42.06 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  42.92 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0481  uridylate kinase  41.78 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0502  uridylate kinase  41.45 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  42.06 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  43.29 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  42.42 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  42.06 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  40.69 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  41.99 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  41.99 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  44.49 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  42.06 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  42.42 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  44.49 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  38.96 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  42.11 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>