244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0254 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  100 
 
 		 346 aa  708    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  77.01 
 
 		 350 aa  558  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  70.23 
 
 		 343 aa  497  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  70.23 
 
 		 343 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  67.63 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  59.59 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  58.7 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  59.53 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  58.41 
 
 		 346 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  57.48 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  58.7 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  59 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  58.75 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  56.34 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  57.14 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  58.41 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  59 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  60.91 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  55.22 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  55 
 
 		 354 aa  362  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.49 
 
 		 350 aa  362  6e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  56.05 
 
 		 345 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.91 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.85 
 
 		 356 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  55.65 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  58.06 
 
 		 351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  50.88 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  57.35 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.47 
 
 		 348 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.92 
 
 		 348 aa  352  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.89 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.04 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.89 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.89 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.47 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.18 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.18 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  51.8 
 
 		 347 aa  349  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  55.35 
 
 		 378 aa  348  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.31 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  51.88 
 
 		 358 aa  345  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  57.43 
 
 		 345 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.31 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  54.17 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  54.6 
 
 		 355 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.58 
 
 		 350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  54.46 
 
 		 334 aa  335  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.49 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  51.6 
 
 		 354 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.04 
 
 		 353 aa  335  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  54.68 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.85 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.62 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.67 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  51.06 
 
 		 344 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.06 
 
 		 350 aa  333  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  51.02 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  54.41 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  53.23 
 
 		 332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 		 362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.07 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.86 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  49.85 
 
 		 350 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.85 
 
 		 350 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.71 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.12 
 
 		 351 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.12 
 
 		 351 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.41 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  49.56 
 
 		 348 aa  325  7e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.89 
 
 		 348 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.41 
 
 		 353 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.85 
 
 		 328 aa  325  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.98 
 
 		 350 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 351 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.41 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.53 
 
 		 351 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  49.86 
 
 		 353 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  49.57 
 
 		 351 aa  322  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.55 
 
 		 339 aa  321  9.000000000000001e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.57 
 
 		 358 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.66 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.06 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  51.9 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.86 
 
 		 358 aa  318  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.19 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  50 
 
 		 349 aa  315  5e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 354 aa  315  7e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  48.08 
 
 		 327 aa  315  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  51.33 
 
 		 351 aa  315  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  52.84 
 
 		 372 aa  315  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.57 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.08 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.38 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  50.43 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.02 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.86 
 
 		 358 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  52.44 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>