68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2654 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  47.83 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  45.71 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2487  Polyketide cyclase/dehydrase  41.3 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  30.97 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  31.54 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  29.57 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  29.13 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  30.09 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  29.57 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  34.02 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  27.83 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  23.58 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  31.37 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  26.92 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1315  Polyketide cyclase/dehydrase  23.45 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  28.45 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  28 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  27.83 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  30.48 
 
 		 244 aa  50.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2774  hypothetical protein  27.52 
 
 		 156 aa  50.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2141  hypothetical protein  27.62 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  29.81 
 
 		 232 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  24.77 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  30.3 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  26.92 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  31.07 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  23.89 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  27.52 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  27.52 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  30 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  24.55 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.61 
 
 		 1011 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  27.46 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.61 
 
 		 1011 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  25.83 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  31.01 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  29.47 
 
 		 337 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2469  hypothetical protein  26.79 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0314  hypothetical protein  26.92 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000595453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2068  hypothetical protein  28.04 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  31 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  24.14 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 		 187 aa  43.5  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  27.19 
 
 		 328 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  21.13 
 
 		 162 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  27.05 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  26.92 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  29.06 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  23.78 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  23.36 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  24 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  24.32 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  28.18 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  23.28 
 
 		 303 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  25.41 
 
 		 156 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  25.41 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 164 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  24.59 
 
 		 156 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  24.78 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  21.58 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  26.5 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  27.52 
 
 		 148 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>