33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1071 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  583  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  63.25 
 
 
286 aa  364  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  42.81 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  42.81 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  28.63 
 
 
300 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  28.07 
 
 
299 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  31.06 
 
 
305 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  31.06 
 
 
305 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  31.06 
 
 
305 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  28.77 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  28.11 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  30.25 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  26.84 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  27.92 
 
 
332 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  27.65 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  25.11 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  24.62 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  27.84 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  28.16 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  27.24 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  22.54 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  26.52 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  25.44 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  25.44 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  25.44 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  25.44 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  23.57 
 
 
335 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  27 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  27.01 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  24.27 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  24.88 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  26.29 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  23.99 
 
 
363 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>