141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1914 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  100 
 
 
429 aa  866    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  40.17 
 
 
517 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.36 
 
 
319 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.14 
 
 
331 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  28.22 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  27.23 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  28.87 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.02 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  26.52 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.8 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.88 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  28.35 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  30.52 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  24.79 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  35.71 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.05 
 
 
347 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  34.92 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  35.11 
 
 
284 aa  63.9  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  35.71 
 
 
303 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  33.86 
 
 
308 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.38 
 
 
305 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.45 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.26 
 
 
301 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36.43 
 
 
307 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.26 
 
 
301 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.62 
 
 
290 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  24.37 
 
 
258 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.01 
 
 
300 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.59 
 
 
288 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  23.19 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  33.09 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3545  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.56 
 
 
282 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0810177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.09 
 
 
292 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  22.73 
 
 
353 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.79 
 
 
279 aa  57  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.78 
 
 
293 aa  57  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.57 
 
 
289 aa  56.6  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  33.08 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.35 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3896  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.35 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  25 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  31.2 
 
 
286 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  33.06 
 
 
295 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.52 
 
 
295 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  25 
 
 
287 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  25 
 
 
287 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  25 
 
 
287 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.52 
 
 
294 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  24.17 
 
 
289 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.17 
 
 
289 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  24.29 
 
 
288 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  25 
 
 
287 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  25 
 
 
287 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.25 
 
 
287 aa  53.9  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  32.84 
 
 
310 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.25 
 
 
287 aa  53.9  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.3 
 
 
295 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  30.71 
 
 
293 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.1 
 
 
279 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.77 
 
 
295 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  31.82 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  24.88 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  29.84 
 
 
300 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  29.03 
 
 
308 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8699  hypothetical protein  23.62 
 
 
264 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.1 
 
 
282 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.41 
 
 
292 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.33 
 
 
293 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.41 
 
 
292 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.37 
 
 
284 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  26.76 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.92 
 
 
296 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.07 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  25 
 
 
341 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 
297 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.41 
 
 
292 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  24.88 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  25.96 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.96 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.23 
 
 
284 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.13 
 
 
298 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  25.96 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  32.09 
 
 
319 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  25.96 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.96 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  25.96 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  25.96 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  29.37 
 
 
295 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  31.01 
 
 
297 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.06 
 
 
284 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.23 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 
306 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.22 
 
 
291 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.23 
 
 
284 aa  50.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.1 
 
 
300 aa  50.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.75 
 
 
298 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5130  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.6 
 
 
281 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.93 
 
 
291 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.95 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>