More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1674 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  100 
 
 
325 aa  658    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  80 
 
 
325 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  78.15 
 
 
338 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  73.7 
 
 
327 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  74.21 
 
 
317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  69.11 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  65.34 
 
 
326 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  67.89 
 
 
327 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  65.45 
 
 
330 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  64.02 
 
 
328 aa  417  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  63 
 
 
328 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  63.64 
 
 
330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  66.77 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  60.91 
 
 
330 aa  401  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
331 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  63.3 
 
 
326 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  62.9 
 
 
309 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.56 
 
 
345 aa  357  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  56.1 
 
 
328 aa  352  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  58.72 
 
 
326 aa  347  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  56.1 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  53.17 
 
 
331 aa  333  3e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  56.1 
 
 
328 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
329 aa  325  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  51.07 
 
 
327 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  52.06 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
328 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
328 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  47.68 
 
 
327 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  45.86 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
326 aa  278  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  45.06 
 
 
325 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
326 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  44.14 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  35.21 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  37.93 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  33.83 
 
 
323 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  34.32 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  34.8 
 
 
309 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  31.95 
 
 
323 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  33 
 
 
312 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  35.31 
 
 
308 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  34.65 
 
 
308 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2698  aryl-alcohol dehydrogenase-related oxidoreductase  55.77 
 
 
225 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.2103  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  30.51 
 
 
332 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  34.29 
 
 
319 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  34.01 
 
 
330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
333 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  37.01 
 
 
327 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  34.12 
 
 
357 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
319 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1711  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
340 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  33.01 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3281  aldo/keto reductase  35.15 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  31.91 
 
 
329 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  34.75 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0577  aldo/keto reductase  30.09 
 
 
323 aa  146  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1066  aldo/keto reductase  34.33 
 
 
364 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.115194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  34.41 
 
 
318 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.89 
 
 
311 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  28.97 
 
 
311 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  35.81 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.2 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  30.86 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  34.17 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1410  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.48 
 
 
311 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  31.8 
 
 
319 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  29.06 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.48 
 
 
311 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.48 
 
 
311 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.48 
 
 
311 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  30.94 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.48 
 
 
311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  28.83 
 
 
327 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  34.85 
 
 
317 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.27 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  32.92 
 
 
328 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  29.74 
 
 
330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  34.41 
 
 
341 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  30.53 
 
 
311 aa  135  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  32.81 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  31.17 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0759  aldo/keto reductase  33.98 
 
 
302 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.86 
 
 
311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  31.58 
 
 
317 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  33.95 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  32.57 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  34.91 
 
 
317 aa  132  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4115  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.905016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  30.48 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  29.33 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  32.62 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  33.65 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  35.28 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  33.87 
 
 
331 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>