299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0042 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  93.06 
 
 		 85 bp  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  93.06 
 
 		 85 bp  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 81 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 81 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 81 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4806  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4962  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000175711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4957  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5114  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>