22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4988 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  68.58 
 
 		 977 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  79.43 
 
 		 189 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  43.15 
 
 		 1411 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1720  hypothetical protein  60.66 
 
 		 120 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1381 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  35.71 
 
 		 398 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  37.01 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1719  hypothetical protein  60.17 
 
 		 217 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.680386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 945 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  33.06 
 
 		 1478 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  29.96 
 
 		 1602 aa  97.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3987  hypothetical protein  29.61 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1848  hypothetical protein  28.02 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0922205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  27.07 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  25.89 
 
 		 407 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02326  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14650)  28.48 
 
 		 664 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02023  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  30.3 
 
 		 362 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  26.29 
 
 		 683 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  43.64 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  24.6 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>