43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4642 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  185  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  54.35 
 
 
541 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  43.21 
 
 
534 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  43.21 
 
 
534 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  43.21 
 
 
534 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  38.27 
 
 
544 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  38.27 
 
 
544 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  45 
 
 
374 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  44.44 
 
 
536 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  44.44 
 
 
536 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  44.44 
 
 
536 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  43.21 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  42.65 
 
 
537 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  47.83 
 
 
400 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  46.38 
 
 
531 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  46.38 
 
 
531 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  39.51 
 
 
507 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  39.51 
 
 
539 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  37.08 
 
 
545 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  39.02 
 
 
539 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  39.02 
 
 
539 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  37.04 
 
 
534 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
560 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
560 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
560 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
560 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
560 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
560 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
560 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  33.82 
 
 
560 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  33.82 
 
 
560 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  32.86 
 
 
560 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  33.82 
 
 
560 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  33.82 
 
 
560 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  32.86 
 
 
560 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>