47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0869 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  100 
 
 
902 aa  1836    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  31.93 
 
 
894 aa  360  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  31.01 
 
 
888 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  30.17 
 
 
909 aa  328  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  29.14 
 
 
440 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0702  hypothetical protein  27.23 
 
 
500 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.166021  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  31.07 
 
 
429 aa  99  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  30 
 
 
1046 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2003  hypothetical protein  26.97 
 
 
450 aa  89.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189091  normal  0.4485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  31.84 
 
 
432 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  30.25 
 
 
466 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  29.55 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2864  hypothetical protein  23.54 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0981058  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  29.55 
 
 
476 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1614  hypothetical protein  29.41 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190402  normal  0.863337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  30.23 
 
 
1309 aa  81.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  29.63 
 
 
435 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  25.85 
 
 
1311 aa  79  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.56 
 
 
1324 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  29.6 
 
 
1314 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4262  hypothetical protein  24.06 
 
 
377 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.905098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
259 aa  72.8  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  25.41 
 
 
1098 aa  71.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1136  cell division inhibitor  28.43 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0412072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1254  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 
250 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  28.25 
 
 
436 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 
257 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2066  hypothetical protein  25.68 
 
 
478 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.380444  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0302  ParA family protein  27.36 
 
 
257 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0302  cell division inhibitor  27.36 
 
 
257 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2993  hypothetical protein  23.68 
 
 
481 aa  60.1  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  25.91 
 
 
1326 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  63.64 
 
 
1017 aa  57.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 
254 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1170  cell division inhibitor  25.1 
 
 
256 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4205  hypothetical protein  23.21 
 
 
478 aa  56.6  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0453  ParA family protein  29.08 
 
 
255 aa  56.2  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17430  hypothetical protein  23.69 
 
 
480 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.62 
 
 
911 aa  53.5  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1586  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.5 
 
 
253 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0407218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2172  hypothetical protein  25.99 
 
 
266 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.517611  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0220  cell division inhibitor MinD  24.08 
 
 
252 aa  50.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 
304 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N36  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  36.96 
 
 
251 aa  46.2  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2171  hypothetical protein  24.37 
 
 
220 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.26529  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.76 
 
 
294 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.76 
 
 
294 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>