15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0702 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0702  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  1004    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.166021  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2066  hypothetical protein  27.78 
 
 
478 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.380444  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4205  hypothetical protein  27.24 
 
 
478 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17430  hypothetical protein  26.38 
 
 
480 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2993  hypothetical protein  27.64 
 
 
481 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1501  hypothetical protein  39.9 
 
 
207 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000100126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1615  hypothetical protein  25.71 
 
 
506 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.925235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0500  hypothetical protein  40.56 
 
 
208 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2171  hypothetical protein  33.04 
 
 
220 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.26529  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  27.23 
 
 
902 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1100  hypothetical protein  38.33 
 
 
208 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  25.35 
 
 
888 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2172  hypothetical protein  28.46 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.517611  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  23.38 
 
 
894 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  24.38 
 
 
909 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>