More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4208 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1831  HSP90 family protein  65.86 
 
 
646 aa  719    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  62.92 
 
 
598 aa  689    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
589 aa  1157    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  52.36 
 
 
585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  51.59 
 
 
643 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0267  HSP90 family protein  46.65 
 
 
661 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.979719  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  48 
 
 
622 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23120  molecular chaperone of HSP90 family  44.07 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  37.46 
 
 
613 aa  399  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  36.2 
 
 
621 aa  340  5.9999999999999996e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  29.44 
 
 
838 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  28.57 
 
 
872 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  27.61 
 
 
594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  33.58 
 
 
608 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4284  hypothetical protein  33.5 
 
 
611 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01954  Hsp90xo protein  33.33 
 
 
622 aa  156  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  26.02 
 
 
633 aa  152  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  23.37 
 
 
625 aa  148  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50590  HSP90 family protein  33.68 
 
 
636 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  31.47 
 
 
650 aa  143  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4309  HSP90 family protein  33.42 
 
 
617 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  23.82 
 
 
628 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  22.59 
 
 
656 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  23.86 
 
 
627 aa  140  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  27.03 
 
 
628 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  23.89 
 
 
615 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  22.38 
 
 
628 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  22.73 
 
 
634 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  31.18 
 
 
611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2197  heat shock protein 90  27.75 
 
 
660 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  24.11 
 
 
626 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  27.21 
 
 
624 aa  133  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  27.21 
 
 
624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  27.21 
 
 
624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  27.21 
 
 
624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  25.89 
 
 
634 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  27.21 
 
 
624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  27.21 
 
 
624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  27.21 
 
 
624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  27.21 
 
 
624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1146  Hsp90xo protein  31.94 
 
 
618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  25.06 
 
 
603 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  30.95 
 
 
611 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  26.73 
 
 
624 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  27.21 
 
 
624 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  26.73 
 
 
624 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  26.73 
 
 
624 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  26.73 
 
 
624 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  24.3 
 
 
623 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  26.04 
 
 
650 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  26.1 
 
 
651 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  22.82 
 
 
610 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  25.74 
 
 
644 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  25.18 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  26.56 
 
 
651 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0703  heat shock protein 90  25.66 
 
 
609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  22.98 
 
 
634 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  24.02 
 
 
615 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  26.32 
 
 
624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  26.09 
 
 
628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  26.09 
 
 
628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  25.89 
 
 
627 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  26.49 
 
 
624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  26.32 
 
 
624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  26.32 
 
 
622 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  22.98 
 
 
634 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  26.21 
 
 
650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  25.12 
 
 
629 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  25.12 
 
 
629 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  25.78 
 
 
624 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  26.3 
 
 
626 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4676  heat shock protein 90  26.32 
 
 
657 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  25.11 
 
 
634 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  26.38 
 
 
623 aa  127  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  20.58 
 
 
634 aa  127  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  30.24 
 
 
606 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  20.41 
 
 
634 aa  127  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  23.76 
 
 
632 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  25.64 
 
 
669 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  22.74 
 
 
634 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  26.3 
 
 
646 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  27.6 
 
 
630 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  26.29 
 
 
637 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  23.24 
 
 
644 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1264  heat shock protein 90  23.56 
 
 
630 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  25.65 
 
 
636 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  27.72 
 
 
643 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  27.81 
 
 
630 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  24.27 
 
 
645 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1348  heat shock protein 90  23.67 
 
 
618 aa  125  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  21.65 
 
 
629 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26010  TRAP1, Heat Shock Protein 90  27.1 
 
 
700 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0886232  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  24.71 
 
 
647 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1006  heat shock protein 90  24.32 
 
 
612 aa  125  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.511721  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0625  heat shock protein 90  24.93 
 
 
608 aa  124  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  25.32 
 
 
657 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  24.2 
 
 
619 aa  124  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  26.82 
 
 
657 aa  124  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  24.3 
 
 
623 aa  124  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  26.1 
 
 
627 aa  124  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>