36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3549 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
881 aa  1701    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8050  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  38.77 
 
 
852 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8049  hypothetical protein  37.05 
 
 
891 aa  318  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4158  protein of unknown function DUF214  33.37 
 
 
934 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434869  normal  0.0912085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  31.42 
 
 
926 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4811  protein of unknown function DUF214  34.08 
 
 
998 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.661642  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0699  protein of unknown function DUF214  30.04 
 
 
934 aa  184  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3175  protein of unknown function DUF214  34.85 
 
 
910 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612521  normal  0.0435773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0830  protein of unknown function DUF214  33.14 
 
 
958 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.800045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 
878 aa  68.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 
848 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06210  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.65 
 
 
933 aa  64.3  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.6 
 
 
857 aa  63.9  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.43 
 
 
854 aa  61.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.73 
 
 
858 aa  58.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 
838 aa  58.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 
443 aa  54.7  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.05 
 
 
859 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  36.08 
 
 
858 aa  52  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  35.78 
 
 
849 aa  51.6  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.13 
 
 
841 aa  50.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 
855 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 
855 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  34.86 
 
 
849 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.59 
 
 
850 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 
452 aa  47.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.33 
 
 
871 aa  47.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 
930 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.01 
 
 
866 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  38.89 
 
 
640 aa  47  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 
846 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  31.92 
 
 
823 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  30.46 
 
 
847 aa  46.2  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  19.14 
 
 
400 aa  45.4  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  25.99 
 
 
821 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  24.79 
 
 
350 aa  45.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>