24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1950 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 778 aa  1516    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  39.8 
 
 		 721 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  32.82 
 
 		 737 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  30.31 
 
 		 670 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 800 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0427  hypothetical protein  62.35 
 
 		 276 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  28.57 
 
 		 844 aa  177  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1046 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  29.03 
 
 		 481 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  25.61 
 
 		 715 aa  107  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  31.05 
 
 		 841 aa  87.8  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.8 
 
 		 880 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.52 
 
 		 880 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  31.19 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.19 
 
 		 778 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.7 
 
 		 825 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  23.18 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.28 
 
 		 649 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.94 
 
 		 872 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  31.01 
 
 		 570 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.43 
 
 		 908 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.38 
 
 		 887 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  34.15 
 
 		 1150 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.77 
 
 		 805 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>