46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0688 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0688  phage protein gp25  100 
 
 		 115 aa  233  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  43.48 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  33.67 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  41.79 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  35.05 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  44.26 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  43.08 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  43.28 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  40.3 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  43.28 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  42.62 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  34.04 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  39.06 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  39.06 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  46.3 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  46.3 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  48 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  48 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  29.41 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  36.92 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  35.82 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  29.7 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  42.31 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  30.39 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  35.29 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  27.45 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  29.7 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  39.06 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  31.91 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  33.82 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  40 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  26.85 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  35.29 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  37.88 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  37.88 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  30.3 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  27.88 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  40 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  33.33 
 
 		 115 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 119 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  33.33 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>