More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0202 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 511 aa  1040    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  52.69 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  50.7 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  47.56 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  49.5 
 
 		 506 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  49.21 
 
 		 508 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  49.21 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  48.32 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  48.32 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  51 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  48.92 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  47.95 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  47.83 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  51.2 
 
 		 497 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  51.02 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  47.51 
 
 		 507 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  48.47 
 
 		 530 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3653  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  47.52 
 
 		 507 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  48.6 
 
 		 498 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  47.32 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  48.14 
 
 		 506 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  47.32 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  49.05 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  48.05 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  47.71 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  47.32 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  47.32 
 
 		 506 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  47.32 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  48.04 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  48.51 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  47.32 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  49.8 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  46.92 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  48.82 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  48.82 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  47.12 
 
 		 506 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  46.72 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  48.2 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  48.22 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  46.52 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  46.32 
 
 		 506 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  47.12 
 
 		 506 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  46.52 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  49.01 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  49.5 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  46.92 
 
 		 506 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  47.72 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  51.5 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  47.12 
 
 		 506 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  44.81 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  46.52 
 
 		 506 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  47.83 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  50.9 
 
 		 497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  46.84 
 
 		 508 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  49.4 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  47.63 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  47.35 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  46.35 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  47.83 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  48.13 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  48.69 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  46.92 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  49.9 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 501 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  50.4 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  45.85 
 
 		 507 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  48.02 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  46.48 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  44.42 
 
 		 512 aa  445  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0082  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  45.96 
 
 		 549 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  47.81 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  44.53 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  44.81 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  45.42 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  47.45 
 
 		 510 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  46.69 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  44.51 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  46.35 
 
 		 517 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  46.47 
 
 		 510 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  47.14 
 
 		 523 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  47.62 
 
 		 534 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  46.78 
 
 		 515 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  50.8 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  43.84 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  45.19 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  50.8 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  49.71 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  44.92 
 
 		 509 aa  432  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  46.88 
 
 		 517 aa  432  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  43.75 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  44.81 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  43.84 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0392  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 		 504 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  47.15 
 
 		 569 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>