267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2400 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  100 
 
 		 87 aa  176  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  69.05 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  69.05 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  68.24 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  65.48 
 
 		 86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  65.48 
 
 		 86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  65.48 
 
 		 86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  67.06 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  67.47 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  64.71 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  66.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  64.71 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  65.88 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  67.06 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  67.09 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  69.62 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  60.71 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  65.43 
 
 		 83 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  64.2 
 
 		 83 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  62.35 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  60.71 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  64.56 
 
 		 81 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  62.35 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  63.1 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  59.3 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  62.35 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  62.35 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  56.98 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  61.9 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  59.52 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  63.29 
 
 		 80 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  61.73 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  56.47 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  60.47 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  57.14 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  54.12 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  54.76 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  50.57 
 
 		 86 aa  93.2  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  53.49 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  50 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  55.42 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  54.88 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 85 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  48.81 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  54.12 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  50 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  54.76 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  50 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 115 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  51.76 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  50 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  51.76 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  52.94 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  49.41 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 85 aa  84.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  50.59 
 
 		 86 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  51.76 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  52.38 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  44.71 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  45.35 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  45.24 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  50 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  50.59 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  46.99 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  45.24 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  50 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>