More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2162 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  31.4 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  27.49 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  29.17 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  29.71 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  26.37 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.32 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  26.9 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  26.32 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  26.32 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  26.9 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  26.9 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  32.89 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  28.57 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3934  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  26.01 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.33 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.58 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  30.06 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  30.83 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3573  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.96 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.716424  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  28.81 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  31.35 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 267 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3431  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.91 
 
 		 403 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.33 
 
 		 296 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 310 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  29.53 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1047  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.85 
 
 		 403 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 246 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  29.68 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 276 aa  51.6  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  25.71 
 
 		 286 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 271 aa  51.6  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  29.34 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  36 
 
 		 581 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  29.23 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.66 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  33.58 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  29.89 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  25 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  33.08 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.96 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 261 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  33.08 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  34.19 
 
 		 394 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.17 
 
 		 251 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.72 
 
 		 299 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  31.5 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.86 
 
 		 422 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.399037  hitchhiker  0.0000000665268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  35.51 
 
 		 253 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  35.59 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.16 
 
 		 296 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  32.12 
 
 		 251 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 252 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  33.96 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 262 aa  48.5  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 341 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  26.63 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  32.09 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  26.63 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  26.63 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 274 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  31.61 
 
 		 394 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.76 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.7 
 
 		 541 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  23.91 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2619  tellurite resistance protein TehB  26.54 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  29.24 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  27.01 
 
 		 253 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  32.17 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>