31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1367 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  49.79 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  48.15 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  45.64 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1774  periplasmic or secreted lipoprotein  37.4 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0221772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0986  transport-associated  41.8 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3274  transport-associated protein  43.03 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  42.04 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4370  transport-associated protein  40 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4872  hypothetical protein  39.84 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  30.45 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  27.05 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  31.15 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  32.77 
 
 		 543 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  25.96 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  29.27 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  33.07 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  32.52 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  31.03 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  31.62 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  34.4 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  32.23 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  32.23 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1133  transport-associated  50 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  26.4 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  28.35 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  31.09 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  27.2 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  32.26 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  30.4 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  31.09 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>