120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1312 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1312  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 
737 aa  1470    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2784  glucosyltransferase MdoH  60.41 
 
 
660 aa  732    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1115  glucosyltransferase MdoH  59.4 
 
 
656 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0871  glucosyltransferase MdoH  59.68 
 
 
694 aa  726    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.079101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3378  glucosyltransferase MdoH  59.21 
 
 
631 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1793  glucosyltransferase MdoH  60.59 
 
 
717 aa  664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0963  glucosyltransferase MdoH  59.59 
 
 
671 aa  736    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4034  glucosyltransferase MdoH  50.38 
 
 
861 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4754  glucosyltransferase MdoH  50.3 
 
 
823 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  48.52 
 
 
860 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  48.2 
 
 
852 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  47.68 
 
 
862 aa  588  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01046  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00471398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2596  glycosyl transferase family 2  45.22 
 
 
837 aa  561  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0184053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1286  glucosyltransferase MdoH  47.49 
 
 
832 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1171  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0293164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1170  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  561  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2550  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000666555  normal  0.464032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2080  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
837 aa  561  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144186  normal  0.981326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2281  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  561  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0709206  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1429  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
837 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00571263  normal  0.261445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1247  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1262  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52358  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1218  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2038  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2222  glucosyltransferase MdoH  45.22 
 
 
847 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1565  glucosyltransferase MdoH  45.31 
 
 
842 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0429551  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0374  glucosyltransferase MdoH  44.78 
 
 
856 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67065  glucosyltransferase MdoH  45.95 
 
 
861 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5816  glucosyltransferase MdoH  46.1 
 
 
860 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5161  periplasmic glucan biosynthesis protein  43.96 
 
 
859 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5025  glucosyltransferase MdoH  45.42 
 
 
857 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0378  glucosyltransferase MdoH  44.02 
 
 
860 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4899  glucosyltransferase MdoH  45.42 
 
 
857 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0440  glucosyltransferase MdoH  45.14 
 
 
857 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1871  glucosyltransferase MdoH  44.76 
 
 
853 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.173445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5075  glucosyltransferase MdoH  45.01 
 
 
857 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2522  glucosyltransferase MdoH  45.3 
 
 
854 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.964049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1571  glucosyltransferase MdoH  45.1 
 
 
849 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2827  glucosyltransferase MdoH  45.3 
 
 
854 aa  525  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1605  glucosyltransferase MdoH  44.43 
 
 
849 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45520  glucosyltransferase MdoH  46.11 
 
 
851 aa  522  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45500  glucosyltransferase MdoH  45.91 
 
 
866 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.00174116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3235  glucosyltransferase MdoH  46.59 
 
 
845 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471813  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1553  glucosyltransferase MdoH  44.28 
 
 
854 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1662  glucosyltransferase MdoH  44.28 
 
 
869 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0962  glucosyltransferase MdoH  40.45 
 
 
692 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1077  glucosyltransferase MdoH  40.45 
 
 
692 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3861  glucosyltransferase MdoH  42.76 
 
 
715 aa  436  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0591  glucosyltransferase MdoH  44.02 
 
 
698 aa  432  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1260  glucosyltransferase MdoH  42.27 
 
 
713 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  38.26 
 
 
679 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1668  glucosyltransferase MdoH  41.58 
 
 
701 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2578  glucosyltransferase MdoH  42.48 
 
 
716 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0580  glucosyltransferase MdoH  38.5 
 
 
704 aa  385  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2781  glucosyltransferase MdoH  39.93 
 
 
720 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.861199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0711  glucosyltransferase MdoH  38.98 
 
 
734 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2133  glucosyltransferase MdoH  39.21 
 
 
680 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1805  glucosyltransferase MdoH  37.92 
 
 
741 aa  361  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710428  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2396  glucosyltransferase MdoH  38.21 
 
 
727 aa  359  9e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000873384  normal  0.0538821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1923  glucosyltransferase MdoH  38.76 
 
 
727 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1930  glucosyltransferase MdoH  38.76 
 
 
727 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03974  glucosyltransferase MdoH  37.02 
 
 
664 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.472032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  39.6 
 
 
641 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1897  glucosyltransferase MdoH  38.76 
 
 
727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3970  glucosyltransferase MdoH  39.35 
 
 
724 aa  355  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3962  glucosyltransferase MdoH  38.99 
 
 
724 aa  355  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  37.78 
 
 
641 aa  354  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0891  glycosyl transferase family 2  39.62 
 
 
683 aa  354  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3675  glucosyltransferase MdoH  39.17 
 
 
724 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1229  glucosyltransferase MdoH  38.61 
 
 
634 aa  352  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1262  glucosyltransferase MdoH  38.43 
 
 
634 aa  351  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3221  glucosyltransferase MdoH  41.14 
 
 
721 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2080  glucosyltransferase MdoH  40 
 
 
727 aa  349  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  39.66 
 
 
611 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2987  glucosyltransferase MdoH  41.28 
 
 
719 aa  347  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510147  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2108  glucosyltransferase MdoH  39.56 
 
 
727 aa  347  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3847  glucosyltransferase MdoH  39.04 
 
 
730 aa  345  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1692  glucosyltransferase MdoH  38.42 
 
 
707 aa  345  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1823  glucosyltransferase MdoH  38.72 
 
 
704 aa  345  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1888  glucosyltransferase MdoH  39.45 
 
 
727 aa  344  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1830  glucosyltransferase MdoH  39.45 
 
 
727 aa  343  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.967734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  38.49 
 
 
721 aa  343  9e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2147  glucosyltransferase MdoH  39.45 
 
 
727 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.687913  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0906  glucosyltransferase MdoH  36.59 
 
 
721 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00127362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5502  glucosyltransferase MdoH  38.61 
 
 
703 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.31495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2250  glucosyltransferase MdoH  38.31 
 
 
681 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3234  glucosyltransferase MdoH  38.81 
 
 
676 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3902  glucosyltransferase MdoH  38.17 
 
 
642 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3489  glucosyltransferase MdoH  38.76 
 
 
624 aa  306  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465641  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1412  glucosyltransferase MdoH  41.02 
 
 
624 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1315  glucosyltransferase MdoH  37.52 
 
 
724 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.654742  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1582  glucosyltransferase MdoH  37.52 
 
 
724 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0190958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  34.21 
 
 
716 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2974  glucosyltransferase MdoH  36.45 
 
 
643 aa  291  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1303  glucosyltransferase MdoH  31.74 
 
 
706 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2856  glucosyltransferase MdoH  36.75 
 
 
643 aa  286  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3082  glucosyltransferase MdoH  36.28 
 
 
643 aa  286  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1535  glucosyltransferase MdoH  34.43 
 
 
630 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217961  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3042  glucosyltransferase MdoH  36.2 
 
 
598 aa  284  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>