123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2784 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1312  glucosyltransferase MdoH  60.41 
 
 		 737 aa  740    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0963  glucosyltransferase MdoH  72.73 
 
 		 671 aa  972    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2784  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 		 660 aa  1341    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1115  glucosyltransferase MdoH  83.48 
 
 		 656 aa  1110    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0871  glucosyltransferase MdoH  72.21 
 
 		 694 aa  951    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.079101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3378  glucosyltransferase MdoH  84.46 
 
 		 631 aa  1076    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1793  glucosyltransferase MdoH  53.82 
 
 		 717 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4034  glucosyltransferase MdoH  46.1 
 
 		 861 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4754  glucosyltransferase MdoH  47.98 
 
 		 823 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1605  glucosyltransferase MdoH  46.47 
 
 		 849 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0374  glucosyltransferase MdoH  46.65 
 
 		 856 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1662  glucosyltransferase MdoH  47.21 
 
 		 869 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5025  glucosyltransferase MdoH  45.97 
 
 		 857 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5161  periplasmic glucan biosynthesis protein  46.2 
 
 		 859 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4899  glucosyltransferase MdoH  45.97 
 
 		 857 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1553  glucosyltransferase MdoH  47.21 
 
 		 854 aa  532  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1247  glucosyltransferase MdoH  45.95 
 
 		 847 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1262  glucosyltransferase MdoH  45.95 
 
 		 847 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1218  glucosyltransferase MdoH  45.95 
 
 		 847 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2038  glucosyltransferase MdoH  45.95 
 
 		 847 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2222  glucosyltransferase MdoH  45.95 
 
 		 847 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01046  glucosyltransferase MdoH  45.35 
 
 		 847 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00471398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2596  glycosyl transferase family 2  45.35 
 
 		 837 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0184053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0378  glucosyltransferase MdoH  46.2 
 
 		 860 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67065  glucosyltransferase MdoH  46.9 
 
 		 861 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  49.16 
 
 		 860 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5816  glucosyltransferase MdoH  46.9 
 
 		 860 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1171  glucosyltransferase MdoH  45.35 
 
 		 847 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0293164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1170  glucosyltransferase MdoH  45.35 
 
 		 847 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1871  glucosyltransferase MdoH  45.87 
 
 		 853 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.173445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1571  glucosyltransferase MdoH  46.31 
 
 		 849 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5075  glucosyltransferase MdoH  45.81 
 
 		 857 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2550  glucosyltransferase MdoH  45.35 
 
 		 847 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000666555  normal  0.464032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2080  glucosyltransferase MdoH  45.35 
 
 		 837 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144186  normal  0.981326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0440  glucosyltransferase MdoH  46.12 
 
 		 857 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2281  glucosyltransferase MdoH  45.35 
 
 		 847 aa  528  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0709206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  48.99 
 
 		 852 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1429  glucosyltransferase MdoH  45.35 
 
 		 837 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00571263  normal  0.261445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  48.83 
 
 		 862 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1286  glucosyltransferase MdoH  45.51 
 
 		 832 aa  522  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1565  glucosyltransferase MdoH  45.59 
 
 		 842 aa  521  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0429551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2522  glucosyltransferase MdoH  45.91 
 
 		 854 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.964049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45520  glucosyltransferase MdoH  46.93 
 
 		 851 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2827  glucosyltransferase MdoH  45.91 
 
 		 854 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45500  glucosyltransferase MdoH  47.88 
 
 		 866 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.00174116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3235  glucosyltransferase MdoH  47.03 
 
 		 845 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3861  glucosyltransferase MdoH  41.85 
 
 		 715 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0591  glucosyltransferase MdoH  40.58 
 
 		 698 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0962  glucosyltransferase MdoH  38.67 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1077  glucosyltransferase MdoH  38.67 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1260  glucosyltransferase MdoH  41.11 
 
 		 713 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2578  glucosyltransferase MdoH  41.87 
 
 		 716 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0580  glucosyltransferase MdoH  39.06 
 
 		 704 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  37.93 
 
 		 679 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1668  glucosyltransferase MdoH  38.74 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03974  glucosyltransferase MdoH  35.22 
 
 		 664 aa  359  9e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.472032  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0891  glycosyl transferase family 2  36.71 
 
 		 683 aa  349  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3970  glucosyltransferase MdoH  37.99 
 
 		 724 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3675  glucosyltransferase MdoH  37.99 
 
 		 724 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3962  glucosyltransferase MdoH  37.52 
 
 		 724 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  36.25 
 
 		 641 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2133  glucosyltransferase MdoH  37.46 
 
 		 680 aa  342  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0906  glucosyltransferase MdoH  36.26 
 
 		 721 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00127362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  36.72 
 
 		 641 aa  340  5.9999999999999996e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3847  glucosyltransferase MdoH  37.38 
 
 		 730 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1692  glucosyltransferase MdoH  36.79 
 
 		 707 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5502  glucosyltransferase MdoH  36.87 
 
 		 703 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.31495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1823  glucosyltransferase MdoH  36.31 
 
 		 704 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  38.32 
 
 		 611 aa  336  7e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2396  glucosyltransferase MdoH  36.43 
 
 		 727 aa  336  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000873384  normal  0.0538821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1897  glucosyltransferase MdoH  36.25 
 
 		 727 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1923  glucosyltransferase MdoH  36.25 
 
 		 727 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1930  glucosyltransferase MdoH  36.25 
 
 		 727 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1805  glucosyltransferase MdoH  37.43 
 
 		 741 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2108  glucosyltransferase MdoH  36.07 
 
 		 727 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2080  glucosyltransferase MdoH  36.45 
 
 		 727 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1830  glucosyltransferase MdoH  35.7 
 
 		 727 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.967734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2147  glucosyltransferase MdoH  35.7 
 
 		 727 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.687913  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1888  glucosyltransferase MdoH  35.7 
 
 		 727 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2987  glucosyltransferase MdoH  37.75 
 
 		 719 aa  324  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2781  glucosyltransferase MdoH  35.37 
 
 		 720 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.861199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  37.65 
 
 		 721 aa  323  6e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1229  glucosyltransferase MdoH  37.45 
 
 		 634 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3221  glucosyltransferase MdoH  36.42 
 
 		 721 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152061  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1262  glucosyltransferase MdoH  37.27 
 
 		 634 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0711  glucosyltransferase MdoH  35.52 
 
 		 734 aa  320  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3234  glucosyltransferase MdoH  35.7 
 
 		 676 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3489  glucosyltransferase MdoH  35.92 
 
 		 624 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  32.89 
 
 		 716 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2250  glucosyltransferase MdoH  34.99 
 
 		 681 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1412  glucosyltransferase MdoH  40 
 
 		 624 aa  293  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3902  glucosyltransferase MdoH  36.65 
 
 		 642 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1303  glucosyltransferase MdoH  32.48 
 
 		 706 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2856  glucosyltransferase MdoH  36.01 
 
 		 643 aa  283  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3082  glucosyltransferase MdoH  36.01 
 
 		 643 aa  283  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1535  glucosyltransferase MdoH  34.62 
 
 		 630 aa  282  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217961  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2974  glucosyltransferase MdoH  34.97 
 
 		 643 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1315  glucosyltransferase MdoH  33.15 
 
 		 724 aa  270  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.654742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1582  glucosyltransferase MdoH  33.15 
 
 		 724 aa  270  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0190958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3199  glucosyltransferase MdoH  35.23 
 
 		 625 aa  263  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>