121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4754 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01046  glucosyltransferase MdoH  55.43 
 
 		 847 aa  837    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00471398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2596  glycosyl transferase family 2  55.43 
 
 		 837 aa  835    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0184053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5025  glucosyltransferase MdoH  55.28 
 
 		 857 aa  874    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2909  glucosyltransferase MdoH  62.09 
 
 		 862 aa  966    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.136414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5161  periplasmic glucan biosynthesis protein  53.76 
 
 		 859 aa  853    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0378  glucosyltransferase MdoH  53.61 
 
 		 860 aa  858    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4034  glucosyltransferase MdoH  83.85 
 
 		 861 aa  1423    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0374  glucosyltransferase MdoH  54.86 
 
 		 856 aa  851    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2827  glucosyltransferase MdoH  57.07 
 
 		 854 aa  843    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1286  glucosyltransferase MdoH  54.07 
 
 		 832 aa  823    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4754  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 		 823 aa  1677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67065  glucosyltransferase MdoH  58.07 
 
 		 861 aa  841    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2522  glucosyltransferase MdoH  55.34 
 
 		 854 aa  853    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.964049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45520  glucosyltransferase MdoH  57.37 
 
 		 851 aa  843    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45500  glucosyltransferase MdoH  54.61 
 
 		 866 aa  766    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  unclonable  0.00174116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1565  glucosyltransferase MdoH  53.47 
 
 		 842 aa  811    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0429551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3235  glucosyltransferase MdoH  55.52 
 
 		 845 aa  811    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4899  glucosyltransferase MdoH  55.28 
 
 		 857 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5816  glucosyltransferase MdoH  56.38 
 
 		 860 aa  846    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1553  glucosyltransferase MdoH  53.86 
 
 		 854 aa  816    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1171  glucosyltransferase MdoH  55.43 
 
 		 847 aa  837    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0293164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1170  glucosyltransferase MdoH  55.43 
 
 		 847 aa  837    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1871  glucosyltransferase MdoH  55.08 
 
 		 853 aa  837    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.173445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1571  glucosyltransferase MdoH  54.02 
 
 		 849 aa  840    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5075  glucosyltransferase MdoH  55.03 
 
 		 857 aa  874    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1662  glucosyltransferase MdoH  53.86 
 
 		 869 aa  817    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2550  glucosyltransferase MdoH  55.43 
 
 		 847 aa  837    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000666555  normal  0.464032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2080  glucosyltransferase MdoH  55.43 
 
 		 837 aa  836    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144186  normal  0.981326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0440  glucosyltransferase MdoH  54.76 
 
 		 857 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2806  glucosyltransferase MdoH  62.56 
 
 		 860 aa  984    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1605  glucosyltransferase MdoH  55.68 
 
 		 849 aa  840    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2281  glucosyltransferase MdoH  55.43 
 
 		 847 aa  838    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0709206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3155  glucosyltransferase MdoH  62.58 
 
 		 852 aa  984    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0101464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1247  glucosyltransferase MdoH  52.93 
 
 		 847 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1262  glucosyltransferase MdoH  52.93 
 
 		 847 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1218  glucosyltransferase MdoH  52.93 
 
 		 847 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2038  glucosyltransferase MdoH  52.93 
 
 		 847 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2222  glucosyltransferase MdoH  52.93 
 
 		 847 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1429  glucosyltransferase MdoH  55.43 
 
 		 837 aa  835    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00571263  normal  0.261445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0591  glucosyltransferase MdoH  48.72 
 
 		 698 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000396207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3861  glucosyltransferase MdoH  46.83 
 
 		 715 aa  613  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1312  glucosyltransferase MdoH  50.69 
 
 		 737 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0963  glucosyltransferase MdoH  46.41 
 
 		 671 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2784  glucosyltransferase MdoH  47.98 
 
 		 660 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  43.81 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0962  glucosyltransferase MdoH  43 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1077  glucosyltransferase MdoH  43 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2578  glucosyltransferase MdoH  46.32 
 
 		 716 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0871  glucosyltransferase MdoH  47.22 
 
 		 694 aa  535  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.079101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1115  glucosyltransferase MdoH  46.8 
 
 		 656 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1793  glucosyltransferase MdoH  51.75 
 
 		 717 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3378  glucosyltransferase MdoH  48.38 
 
 		 631 aa  525  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1260  glucosyltransferase MdoH  43.78 
 
 		 713 aa  525  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1668  glucosyltransferase MdoH  41.04 
 
 		 701 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0580  glucosyltransferase MdoH  40.12 
 
 		 704 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2396  glucosyltransferase MdoH  41.73 
 
 		 727 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000873384  normal  0.0538821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3847  glucosyltransferase MdoH  40.8 
 
 		 730 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1897  glucosyltransferase MdoH  41.73 
 
 		 727 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2080  glucosyltransferase MdoH  42.25 
 
 		 727 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1923  glucosyltransferase MdoH  41.73 
 
 		 727 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1930  glucosyltransferase MdoH  41.73 
 
 		 727 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0711  glucosyltransferase MdoH  40.09 
 
 		 734 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  41.2 
 
 		 641 aa  458  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1823  glucosyltransferase MdoH  41.8 
 
 		 704 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5502  glucosyltransferase MdoH  40.41 
 
 		 703 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.31495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2108  glucosyltransferase MdoH  41.62 
 
 		 727 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1830  glucosyltransferase MdoH  41.77 
 
 		 727 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.967734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2147  glucosyltransferase MdoH  41.77 
 
 		 727 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.687913  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1888  glucosyltransferase MdoH  41.59 
 
 		 727 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3970  glucosyltransferase MdoH  41.53 
 
 		 724 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3675  glucosyltransferase MdoH  41.17 
 
 		 724 aa  452  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1805  glucosyltransferase MdoH  40.61 
 
 		 741 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3962  glucosyltransferase MdoH  42 
 
 		 724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.868931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03974  glucosyltransferase MdoH  39.12 
 
 		 664 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.472032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1692  glucosyltransferase MdoH  39.86 
 
 		 707 aa  435  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0906  glucosyltransferase MdoH  39.76 
 
 		 721 aa  436  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00127362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2987  glucosyltransferase MdoH  40.59 
 
 		 719 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2133  glucosyltransferase MdoH  38.31 
 
 		 680 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  39.7 
 
 		 721 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0891  glycosyl transferase family 2  38.9 
 
 		 683 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  40.03 
 
 		 611 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2781  glucosyltransferase MdoH  39.83 
 
 		 720 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.861199 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1262  glucosyltransferase MdoH  39.59 
 
 		 634 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1229  glucosyltransferase MdoH  39.59 
 
 		 634 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3221  glucosyltransferase MdoH  38.84 
 
 		 721 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  39.53 
 
 		 641 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  38.27 
 
 		 716 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2250  glucosyltransferase MdoH  39.86 
 
 		 681 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1303  glucosyltransferase MdoH  38 
 
 		 706 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1315  glucosyltransferase MdoH  39.66 
 
 		 724 aa  366  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.654742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1582  glucosyltransferase MdoH  39.66 
 
 		 724 aa  366  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0190958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3234  glucosyltransferase MdoH  38.43 
 
 		 676 aa  344  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3042  glucosyltransferase MdoH  37.04 
 
 		 598 aa  341  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3902  glucosyltransferase MdoH  38.96 
 
 		 642 aa  332  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1412  glucosyltransferase MdoH  38.99 
 
 		 624 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1713  glucosyltransferase MdoH  34.96 
 
 		 595 aa  324  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2974  glucosyltransferase MdoH  37.59 
 
 		 643 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3489  glucosyltransferase MdoH  36.93 
 
 		 624 aa  316  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1764  glucosyltransferase MdoH  36.18 
 
 		 595 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.834244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0127  glucosyltransferase MdoH  35.99 
 
 		 595 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.469295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>